Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Krtap11-1E9Q2E9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms