Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
NebE9Q1W3 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
NebE9Q1W3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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