Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc171E9Q1U1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc171E9Q1U1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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