Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm3250E9Q1M3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3250E9Q1M3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3250E9Q1M3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms