Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Zfp558E9Q1J0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Zfp558E9Q1J0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp558E9Q1J0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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