Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Myo5cE9Q1F5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Myo5cE9Q1F5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Myo5cE9Q1F5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
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