Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gcom1E9PZ54 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gcom1E9PZ54 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms