Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc175E9PVB3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc175E9PVB3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms