Protein–RNA interactions for Protein: E0CXI6

Gm5286, Predicted gene 5286, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5286E0CXI6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm5286E0CXI6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Gm5286E0CXI6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm5286E0CXI6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms