Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Vpreb3D3Z6J4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms