Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms