Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tmf1B9EKI3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tmf1B9EKI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms