Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rd3lB2RV38 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rd3lB2RV38 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms