Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Prrt4B2RU40 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Prrt4B2RU40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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