Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uhrf1bp1B2KF50 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1B2KF50 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Uhrf1bp1B2KF50 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms