Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Brpf3B2KF05 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Brpf3B2KF05 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms