Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem238A9JSM3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms