Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ttll11A4Q9F4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ttll11A4Q9F4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms