Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Htra4A2RT60 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Htra4A2RT60 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms