Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Col6a4A2AX52 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Col6a4A2AX52 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms