Protein–RNA interactions for Protein: A2ALV5

AI481877, Expressed sequence AI481877, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AI481877A2ALV5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
AI481877A2ALV5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
AI481877A2ALV5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
AI481877A2ALV5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AI481877A2ALV5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AI481877A2ALV5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AI481877A2ALV5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
AI481877A2ALV5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
AI481877A2ALV5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
AI481877A2ALV5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
AI481877A2ALV5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms