Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Lcn6A2AJB9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Lcn6A2AJB9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Lcn6A2AJB9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Lcn6A2AJB9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Lcn6A2AJB9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Lcn6A2AJB9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms