Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pramel3A2AHA7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pramel3A2AHA7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pramel3A2AHA7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms