Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cyb561d1A2AE42 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyb561d1A2AE42 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms