Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Prdm16A2A935 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Prdm16A2A935 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Prdm16A2A935 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms