Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Itgb4A2A863 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Itgb4A2A863 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms