Protein–RNA interactions for Protein: A2A7W1

Cd300ld4, CD300 molecule-like family member D4, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld4A2A7W1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cd300ld4A2A7W1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd300ld4A2A7W1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms