Protein–RNA interactions for Protein: A2A559

Pgap3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgap3A2A559 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pgap3A2A559 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pgap3A2A559 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pgap3A2A559 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms