Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fam71e1A1L3C1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fam71e1A1L3C1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms