Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv13-2A0A140T8N6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv13-2A0A140T8N6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-2A0A140T8N6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-2A0A140T8N6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Trbv13-2A0A140T8N6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trbv13-2A0A140T8N6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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