Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQ45

6430628N08Rik, MCG1049118, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430628N08RikA0A0U1RQ45 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
6430628N08RikA0A0U1RQ45 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
6430628N08RikA0A0U1RQ45 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms