Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms