Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B625

Trav4d-3, T cell receptor alpha variable 4D-3 (Fragment), mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trav4d-3A0A075B625 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trav4d-3A0A075B625 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trav4d-3A0A075B625 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Trav4d-3A0A075B625 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Trav4d-3A0A075B625 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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