Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Slc22a4Q9Z306 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Slc22a4Q9Z306 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms