Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vamp5Q9Z2P8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms