Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cacna2d3Q9Z1L5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms