Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z172

Sumo3, Small ubiquitin-related modifier 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo3Q9Z172 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sumo3Q9Z172 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sumo3Q9Z172 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms