Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Clip2Q9Z0H8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clip2Q9Z0H8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clip2Q9Z0H8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms