Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ5

Crybb1, Beta-crystallin B1, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crybb1Q9WVJ5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Crybb1Q9WVJ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Crybb1Q9WVJ5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms