Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PoleQ9WVF7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PoleQ9WVF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms