Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VapaQ9WV55 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VapaQ9WV55 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms