Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bgrQ9WUZ7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bgrQ9WUZ7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms