Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Stub1Q9WUD1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Stub1Q9WUD1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms