Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vax2Q9WTP9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vax2Q9WTP9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms