Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sema6cQ9WTM3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms