Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SPRR3Q9UBC9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SPRR3Q9UBC9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPRR3Q9UBC9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPRR3Q9UBC9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SPRR3Q9UBC9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPRR3Q9UBC9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SPRR3Q9UBC9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms