Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psma1Q9R1P4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psma1Q9R1P4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms