Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Plod2Q9R0B9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Plod2Q9R0B9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms