Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lamc3Q9R0B6 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lamc3Q9R0B6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Lamc3Q9R0B6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms