Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nek3Q9R0A5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nek3Q9R0A5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Nek3Q9R0A5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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